Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB3GAP1Q15042 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB3GAP1Q15042 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB3GAP1Q15042 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB3GAP1Q15042 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB3GAP1Q15042 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB3GAP1Q15042 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB3GAP1Q15042 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB3GAP1Q15042 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB3GAP1Q15042 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB3GAP1Q15042 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB3GAP1Q15042 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB3GAP1Q15042 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB3GAP1Q15042 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB3GAP1Q15042 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB3GAP1Q15042 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB3GAP1Q15042 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB3GAP1Q15042 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB3GAP1Q15042 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB3GAP1Q15042 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB3GAP1Q15042 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB3GAP1Q15042 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB3GAP1Q15042 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB3GAP1Q15042 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB3GAP1Q15042 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB3GAP1Q15042 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB3GAP1Q15042 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB3GAP1Q15042 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB3GAP1Q15042 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB3GAP1Q15042 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB3GAP1Q15042 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB3GAP1Q15042 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB3GAP1Q15042 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB3GAP1Q15042 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB3GAP1Q15042 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB3GAP1Q15042 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB3GAP1Q15042 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB3GAP1Q15042 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB3GAP1Q15042 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB3GAP1Q15042 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB3GAP1Q15042 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB3GAP1Q15042 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB3GAP1Q15042 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB3GAP1Q15042 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB3GAP1Q15042 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB3GAP1Q15042 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB3GAP1Q15042 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB3GAP1Q15042 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB3GAP1Q15042 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RAB3GAP1Q15042 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RAB3GAP1Q15042 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RAB3GAP1Q15042 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RAB3GAP1Q15042 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RAB3GAP1Q15042 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RAB3GAP1Q15042 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RAB3GAP1Q15042 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RAB3GAP1Q15042 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB3GAP1Q15042 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB3GAP1Q15042 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB3GAP1Q15042 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB3GAP1Q15042 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB3GAP1Q15042 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB3GAP1Q15042 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB3GAP1Q15042 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB3GAP1Q15042 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB3GAP1Q15042 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB3GAP1Q15042 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB3GAP1Q15042 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB3GAP1Q15042 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB3GAP1Q15042 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB3GAP1Q15042 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB3GAP1Q15042 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB3GAP1Q15042 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB3GAP1Q15042 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB3GAP1Q15042 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB3GAP1Q15042 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB3GAP1Q15042 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB3GAP1Q15042 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB3GAP1Q15042 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB3GAP1Q15042 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB3GAP1Q15042 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB3GAP1Q15042 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB3GAP1Q15042 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB3GAP1Q15042 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB3GAP1Q15042 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB3GAP1Q15042 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB3GAP1Q15042 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB3GAP1Q15042 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB3GAP1Q15042 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB3GAP1Q15042 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB3GAP1Q15042 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB3GAP1Q15042 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB3GAP1Q15042 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB3GAP1Q15042 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB3GAP1Q15042 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB3GAP1Q15042 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB3GAP1Q15042 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB3GAP1Q15042 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB3GAP1Q15042 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB3GAP1Q15042 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
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