Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
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COL19A1Q14993 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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COL19A1Q14993 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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COL19A1Q14993 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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COL19A1Q14993 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
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COL19A1Q14993 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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COL19A1Q14993 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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COL19A1Q14993 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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COL19A1Q14993 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
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COL19A1Q14993 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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