Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SSPNQ14714 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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