Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFTN1Q14699 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms