Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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GBX1Q14549 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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GBX1Q14549 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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GBX1Q14549 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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GBX1Q14549 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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GBX1Q14549 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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GBX1Q14549 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
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GBX1Q14549 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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GBX1Q14549 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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GBX1Q14549 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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GBX1Q14549 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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GBX1Q14549 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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GBX1Q14549 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GBX1Q14549 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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