Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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