Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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COL4A6Q14031 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
COL4A6Q14031 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
COL4A6Q14031 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
COL4A6Q14031 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
COL4A6Q14031 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
COL4A6Q14031 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
COL4A6Q14031 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
COL4A6Q14031 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
COL4A6Q14031 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
COL4A6Q14031 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
COL4A6Q14031 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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COL4A6Q14031 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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COL4A6Q14031 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
COL4A6Q14031 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
COL4A6Q14031 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
COL4A6Q14031 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
COL4A6Q14031 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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COL4A6Q14031 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
COL4A6Q14031 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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COL4A6Q14031 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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COL4A6Q14031 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COL4A6Q14031 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COL4A6Q14031 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COL4A6Q14031 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COL4A6Q14031 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COL4A6Q14031 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COL4A6Q14031 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COL4A6Q14031 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COL4A6Q14031 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COL4A6Q14031 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COL4A6Q14031 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COL4A6Q14031 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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COL4A6Q14031 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COL4A6Q14031 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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