Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
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