Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBFBQ13951 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms