Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SHROOM2Q13796 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
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