Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ALCAMQ13740 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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