Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms