Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALCOCO2Q13137 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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