Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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PRKAA1Q13131 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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PRKAA1Q13131 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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PRKAA1Q13131 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKAA1Q13131 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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PRKAA1Q13131 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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PRKAA1Q13131 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKAA1Q13131 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms