Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFT88Q13099 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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