Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
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