Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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