Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TROQ12816 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TROQ12816 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TROQ12816 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TROQ12816 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TROQ12816 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TROQ12816 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TROQ12816 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TROQ12816 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TROQ12816 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TROQ12816 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TROQ12816 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TROQ12816 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TROQ12816 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TROQ12816 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TROQ12816 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TROQ12816 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TROQ12816 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TROQ12816 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TROQ12816 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TROQ12816 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TROQ12816 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TROQ12816 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TROQ12816 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TROQ12816 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TROQ12816 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TROQ12816 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TROQ12816 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TROQ12816 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TROQ12816 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TROQ12816 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TROQ12816 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TROQ12816 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TROQ12816 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TROQ12816 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TROQ12816 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TROQ12816 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TROQ12816 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TROQ12816 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TROQ12816 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TROQ12816 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TROQ12816 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TROQ12816 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TROQ12816 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TROQ12816 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TROQ12816 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TROQ12816 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TROQ12816 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TROQ12816 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TROQ12816 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TROQ12816 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TROQ12816 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TROQ12816 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TROQ12816 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TROQ12816 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TROQ12816 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TROQ12816 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TROQ12816 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TROQ12816 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TROQ12816 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TROQ12816 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TROQ12816 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TROQ12816 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TROQ12816 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TROQ12816 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TROQ12816 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TROQ12816 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TROQ12816 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TROQ12816 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TROQ12816 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TROQ12816 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TROQ12816 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TROQ12816 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TROQ12816 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TROQ12816 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TROQ12816 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TROQ12816 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TROQ12816 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TROQ12816 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TROQ12816 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TROQ12816 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TROQ12816 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TROQ12816 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TROQ12816 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TROQ12816 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TROQ12816 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TROQ12816 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TROQ12816 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TROQ12816 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TROQ12816 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TROQ12816 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TROQ12816 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TROQ12816 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TROQ12816 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TROQ12816 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TROQ12816 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TROQ12816 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TROQ12816 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TROQ12816 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TROQ12816 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
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