Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms