Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms