Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN1Q04323 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.8 ms