Protein–RNA interactions for Protein: Q02297

NRG1, Pro-neuregulin-1, membrane-bound isoform, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG1Q02297 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NRG1Q02297 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms