Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms