Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXC5Q00444 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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HOXC5Q00444 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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HOXC5Q00444 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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HOXC5Q00444 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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HOXC5Q00444 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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HOXC5Q00444 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXC5Q00444 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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