Protein–RNA interactions for Protein: Q00266

MAT1A, S-adenosylmethionine synthase isoform type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAT1AQ00266 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAT1AQ00266 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms