Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TFAMQ00059 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms