Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms