Protein–RNA interactions for Protein: P80075

CCL8, C-C motif chemokine 8, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL8P80075 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCL8P80075 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCL8P80075 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCL8P80075 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCL8P80075 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCL8P80075 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCL8P80075 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCL8P80075 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCL8P80075 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCL8P80075 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCL8P80075 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCL8P80075 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCL8P80075 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCL8P80075 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCL8P80075 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCL8P80075 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCL8P80075 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCL8P80075 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCL8P80075 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCL8P80075 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCL8P80075 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCL8P80075 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCL8P80075 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCL8P80075 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCL8P80075 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CCL8P80075 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCL8P80075 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CCL8P80075 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCL8P80075 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCL8P80075 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCL8P80075 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCL8P80075 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCL8P80075 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCL8P80075 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCL8P80075 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCL8P80075 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCL8P80075 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCL8P80075 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCL8P80075 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCL8P80075 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCL8P80075 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCL8P80075 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCL8P80075 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCL8P80075 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCL8P80075 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCL8P80075 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCL8P80075 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCL8P80075 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCL8P80075 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCL8P80075 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCL8P80075 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CCL8P80075 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCL8P80075 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCL8P80075 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCL8P80075 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCL8P80075 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CCL8P80075 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCL8P80075 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCL8P80075 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL8P80075 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL8P80075 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL8P80075 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL8P80075 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL8P80075 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL8P80075 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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CCL8P80075 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL8P80075 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL8P80075 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL8P80075 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL8P80075 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL8P80075 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL8P80075 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL8P80075 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL8P80075 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL8P80075 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL8P80075 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL8P80075 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL8P80075 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL8P80075 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL8P80075 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL8P80075 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL8P80075 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL8P80075 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL8P80075 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL8P80075 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL8P80075 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL8P80075 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL8P80075 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL8P80075 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL8P80075 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL8P80075 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL8P80075 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL8P80075 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL8P80075 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL8P80075 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL8P80075 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL8P80075 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL8P80075 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCL8P80075 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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