Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms