Protein–RNA interactions for Protein: P61011

SRP54, Signal recognition particle 54 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54P61011 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP54P61011 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP54P61011 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP54P61011 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP54P61011 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP54P61011 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP54P61011 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP54P61011 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP54P61011 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP54P61011 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP54P61011 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP54P61011 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP54P61011 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP54P61011 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP54P61011 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP54P61011 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP54P61011 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP54P61011 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP54P61011 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP54P61011 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP54P61011 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP54P61011 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP54P61011 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP54P61011 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP54P61011 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP54P61011 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP54P61011 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP54P61011 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP54P61011 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP54P61011 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP54P61011 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP54P61011 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP54P61011 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP54P61011 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP54P61011 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP54P61011 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP54P61011 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP54P61011 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP54P61011 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP54P61011 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP54P61011 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP54P61011 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP54P61011 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP54P61011 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP54P61011 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP54P61011 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP54P61011 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP54P61011 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP54P61011 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP54P61011 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRP54P61011 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP54P61011 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP54P61011 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP54P61011 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP54P61011 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP54P61011 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP54P61011 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP54P61011 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP54P61011 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP54P61011 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP54P61011 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP54P61011 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP54P61011 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP54P61011 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP54P61011 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP54P61011 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP54P61011 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP54P61011 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP54P61011 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP54P61011 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP54P61011 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP54P61011 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP54P61011 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP54P61011 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP54P61011 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP54P61011 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP54P61011 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP54P61011 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP54P61011 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP54P61011 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP54P61011 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP54P61011 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP54P61011 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP54P61011 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP54P61011 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP54P61011 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP54P61011 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP54P61011 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP54P61011 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP54P61011 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP54P61011 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP54P61011 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP54P61011 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP54P61011 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP54P61011 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRP54P61011 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRP54P61011 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRP54P61011 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRP54P61011 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRP54P61011 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms