Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDK8P49336 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDK8P49336 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDK8P49336 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDK8P49336 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDK8P49336 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDK8P49336 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDK8P49336 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDK8P49336 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDK8P49336 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDK8P49336 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
CDK8P49336 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
CDK8P49336 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
CDK8P49336 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
CDK8P49336 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CDK8P49336 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CDK8P49336 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK8P49336 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK8P49336 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK8P49336 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK8P49336 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK8P49336 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK8P49336 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK8P49336 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK8P49336 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK8P49336 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK8P49336 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK8P49336 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK8P49336 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK8P49336 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK8P49336 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK8P49336 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK8P49336 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK8P49336 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK8P49336 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK8P49336 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK8P49336 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK8P49336 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK8P49336 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK8P49336 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK8P49336 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK8P49336 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK8P49336 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK8P49336 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK8P49336 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK8P49336 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK8P49336 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK8P49336 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK8P49336 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK8P49336 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK8P49336 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK8P49336 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK8P49336 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK8P49336 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK8P49336 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK8P49336 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK8P49336 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK8P49336 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK8P49336 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK8P49336 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK8P49336 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK8P49336 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK8P49336 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK8P49336 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK8P49336 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK8P49336 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK8P49336 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK8P49336 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK8P49336 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK8P49336 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK8P49336 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK8P49336 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK8P49336 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK8P49336 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK8P49336 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK8P49336 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK8P49336 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK8P49336 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK8P49336 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK8P49336 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK8P49336 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK8P49336 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK8P49336 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK8P49336 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK8P49336 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK8P49336 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK8P49336 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK8P49336 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK8P49336 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK8P49336 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK8P49336 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK8P49336 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK8P49336 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK8P49336 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK8P49336 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK8P49336 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK8P49336 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK8P49336 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK8P49336 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK8P49336 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms