Protein–RNA interactions for Protein: P48730

CSNK1D, Casein kinase I isoform delta, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1DP48730 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK1DP48730 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms