Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIA4P48058 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms