Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZEB1P37275 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZEB1P37275 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZEB1P37275 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZEB1P37275 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZEB1P37275 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZEB1P37275 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZEB1P37275 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZEB1P37275 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZEB1P37275 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZEB1P37275 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZEB1P37275 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZEB1P37275 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZEB1P37275 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZEB1P37275 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZEB1P37275 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZEB1P37275 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ZEB1P37275 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ZEB1P37275 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZEB1P37275 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZEB1P37275 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ZEB1P37275 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZEB1P37275 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ZEB1P37275 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZEB1P37275 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZEB1P37275 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZEB1P37275 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms