Protein–RNA interactions for Protein: P35408

PTGER4, Prostaglandin E2 receptor EP4 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER4P35408 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTGER4P35408 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms