Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TSPOP30536 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
TSPOP30536 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TSPOP30536 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TSPOP30536 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TSPOP30536 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TSPOP30536 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TSPOP30536 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TSPOP30536 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TSPOP30536 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TSPOP30536 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TSPOP30536 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TSPOP30536 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TSPOP30536 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TSPOP30536 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TSPOP30536 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TSPOP30536 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TSPOP30536 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TSPOP30536 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TSPOP30536 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TSPOP30536 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TSPOP30536 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TSPOP30536 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TSPOP30536 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TSPOP30536 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TSPOP30536 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TSPOP30536 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TSPOP30536 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TSPOP30536 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TSPOP30536 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TSPOP30536 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TSPOP30536 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TSPOP30536 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TSPOP30536 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TSPOP30536 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TSPOP30536 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TSPOP30536 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TSPOP30536 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TSPOP30536 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TSPOP30536 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TSPOP30536 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TSPOP30536 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TSPOP30536 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TSPOP30536 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TSPOP30536 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TSPOP30536 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TSPOP30536 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TSPOP30536 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TSPOP30536 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TSPOP30536 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TSPOP30536 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TSPOP30536 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TSPOP30536 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TSPOP30536 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TSPOP30536 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TSPOP30536 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TSPOP30536 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TSPOP30536 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TSPOP30536 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TSPOP30536 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TSPOP30536 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TSPOP30536 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TSPOP30536 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TSPOP30536 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TSPOP30536 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TSPOP30536 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TSPOP30536 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TSPOP30536 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TSPOP30536 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TSPOP30536 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TSPOP30536 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TSPOP30536 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TSPOP30536 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TSPOP30536 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TSPOP30536 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TSPOP30536 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TSPOP30536 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TSPOP30536 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TSPOP30536 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TSPOP30536 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TSPOP30536 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TSPOP30536 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TSPOP30536 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TSPOP30536 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TSPOP30536 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TSPOP30536 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
TSPOP30536 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TSPOP30536 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TSPOP30536 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TSPOP30536 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TSPOP30536 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TSPOP30536 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TSPOP30536 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TSPOP30536 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TSPOP30536 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TSPOP30536 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TSPOP30536 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TSPOP30536 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TSPOP30536 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TSPOP30536 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms