Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMBRP28336 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMBRP28336 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMBRP28336 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMBRP28336 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMBRP28336 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMBRP28336 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMBRP28336 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMBRP28336 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMBRP28336 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMBRP28336 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMBRP28336 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMBRP28336 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NMBRP28336 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMBRP28336 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMBRP28336 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMBRP28336 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMBRP28336 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMBRP28336 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMBRP28336 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMBRP28336 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMBRP28336 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMBRP28336 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMBRP28336 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NMBRP28336 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMBRP28336 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMBRP28336 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMBRP28336 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMBRP28336 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMBRP28336 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMBRP28336 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMBRP28336 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMBRP28336 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMBRP28336 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMBRP28336 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMBRP28336 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMBRP28336 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMBRP28336 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMBRP28336 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMBRP28336 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMBRP28336 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMBRP28336 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMBRP28336 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMBRP28336 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMBRP28336 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMBRP28336 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMBRP28336 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMBRP28336 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMBRP28336 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMBRP28336 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMBRP28336 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NMBRP28336 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMBRP28336 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMBRP28336 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMBRP28336 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMBRP28336 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMBRP28336 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMBRP28336 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMBRP28336 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMBRP28336 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMBRP28336 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMBRP28336 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMBRP28336 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMBRP28336 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NMBRP28336 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMBRP28336 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMBRP28336 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMBRP28336 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMBRP28336 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NMBRP28336 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMBRP28336 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMBRP28336 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMBRP28336 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMBRP28336 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NMBRP28336 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMBRP28336 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMBRP28336 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMBRP28336 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMBRP28336 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NMBRP28336 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMBRP28336 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMBRP28336 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMBRP28336 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NMBRP28336 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMBRP28336 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMBRP28336 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMBRP28336 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMBRP28336 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMBRP28336 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMBRP28336 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMBRP28336 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMBRP28336 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMBRP28336 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMBRP28336 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMBRP28336 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMBRP28336 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMBRP28336 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMBRP28336 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMBRP28336 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NMBRP28336 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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