Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRDP23468 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRDP23468 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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