Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TOP2AP11388 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TOP2AP11388 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TOP2AP11388 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TOP2AP11388 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TOP2AP11388 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TOP2AP11388 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
TOP2AP11388 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TOP2AP11388 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TOP2AP11388 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TOP2AP11388 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TOP2AP11388 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TOP2AP11388 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TOP2AP11388 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TOP2AP11388 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TOP2AP11388 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TOP2AP11388 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TOP2AP11388 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TOP2AP11388 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TOP2AP11388 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TOP2AP11388 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TOP2AP11388 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TOP2AP11388 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TOP2AP11388 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TOP2AP11388 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
TOP2AP11388 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TOP2AP11388 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TOP2AP11388 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TOP2AP11388 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TOP2AP11388 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TOP2AP11388 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TOP2AP11388 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TOP2AP11388 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TOP2AP11388 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TOP2AP11388 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TOP2AP11388 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TOP2AP11388 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TOP2AP11388 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TOP2AP11388 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TOP2AP11388 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TOP2AP11388 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TOP2AP11388 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TOP2AP11388 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TOP2AP11388 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TOP2AP11388 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TOP2AP11388 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TOP2AP11388 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TOP2AP11388 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TOP2AP11388 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TOP2AP11388 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TOP2AP11388 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TOP2AP11388 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TOP2AP11388 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TOP2AP11388 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TOP2AP11388 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TOP2AP11388 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TOP2AP11388 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TOP2AP11388 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
TOP2AP11388 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC27.51■■■□□ 2
TOP2AP11388 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
TOP2AP11388 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC27.51■■■□□ 2
TOP2AP11388 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
TOP2AP11388 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
TOP2AP11388 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
TOP2AP11388 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TOP2AP11388 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms