Protein–RNA interactions for Protein: P09016

HOXD4, Homeobox protein Hox-D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 255 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4P09016 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXD4P09016 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD4P09016 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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