Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLK3P07288 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLK3P07288 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KLK3P07288 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KLK3P07288 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KLK3P07288 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLK3P07288 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLK3P07288 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLK3P07288 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLK3P07288 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLK3P07288 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLK3P07288 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLK3P07288 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLK3P07288 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLK3P07288 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLK3P07288 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLK3P07288 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLK3P07288 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLK3P07288 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KLK3P07288 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLK3P07288 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLK3P07288 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLK3P07288 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLK3P07288 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLK3P07288 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLK3P07288 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLK3P07288 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLK3P07288 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLK3P07288 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLK3P07288 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KLK3P07288 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLK3P07288 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLK3P07288 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLK3P07288 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLK3P07288 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLK3P07288 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLK3P07288 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLK3P07288 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLK3P07288 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KLK3P07288 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLK3P07288 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KLK3P07288 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KLK3P07288 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLK3P07288 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLK3P07288 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLK3P07288 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KLK3P07288 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLK3P07288 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLK3P07288 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLK3P07288 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLK3P07288 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLK3P07288 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLK3P07288 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLK3P07288 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLK3P07288 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLK3P07288 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLK3P07288 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLK3P07288 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLK3P07288 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLK3P07288 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLK3P07288 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLK3P07288 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLK3P07288 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLK3P07288 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLK3P07288 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLK3P07288 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLK3P07288 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLK3P07288 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLK3P07288 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLK3P07288 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLK3P07288 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLK3P07288 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLK3P07288 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLK3P07288 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KLK3P07288 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLK3P07288 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLK3P07288 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLK3P07288 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLK3P07288 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLK3P07288 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLK3P07288 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLK3P07288 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KLK3P07288 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLK3P07288 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KLK3P07288 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KLK3P07288 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLK3P07288 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLK3P07288 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLK3P07288 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLK3P07288 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KLK3P07288 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLK3P07288 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLK3P07288 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLK3P07288 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLK3P07288 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLK3P07288 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLK3P07288 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLK3P07288 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLK3P07288 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLK3P07288 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms