Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNSO60931 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNSO60931 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNSO60931 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNSO60931 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNSO60931 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNSO60931 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNSO60931 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNSO60931 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNSO60931 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNSO60931 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNSO60931 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNSO60931 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNSO60931 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNSO60931 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNSO60931 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNSO60931 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNSO60931 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNSO60931 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNSO60931 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNSO60931 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNSO60931 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNSO60931 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNSO60931 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNSO60931 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNSO60931 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNSO60931 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNSO60931 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNSO60931 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNSO60931 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNSO60931 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNSO60931 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNSO60931 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNSO60931 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNSO60931 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNSO60931 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNSO60931 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNSO60931 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNSO60931 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNSO60931 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNSO60931 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNSO60931 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNSO60931 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNSO60931 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNSO60931 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNSO60931 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNSO60931 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNSO60931 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNSO60931 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNSO60931 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNSO60931 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNSO60931 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNSO60931 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNSO60931 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNSO60931 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNSO60931 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNSO60931 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNSO60931 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNSO60931 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNSO60931 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNSO60931 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNSO60931 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNSO60931 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTNSO60931 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTNSO60931 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CTNSO60931 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTNSO60931 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTNSO60931 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CTNSO60931 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTNSO60931 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTNSO60931 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTNSO60931 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTNSO60931 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTNSO60931 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTNSO60931 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTNSO60931 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTNSO60931 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTNSO60931 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTNSO60931 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTNSO60931 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CTNSO60931 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTNSO60931 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTNSO60931 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTNSO60931 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CTNSO60931 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTNSO60931 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTNSO60931 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTNSO60931 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTNSO60931 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTNSO60931 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTNSO60931 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTNSO60931 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CTNSO60931 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTNSO60931 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTNSO60931 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTNSO60931 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTNSO60931 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTNSO60931 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTNSO60931 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTNSO60931 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms