Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms