Protein–RNA interactions for Protein: O43345

ZNF208, Zinc finger protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 1,280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF208O43345 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF208O43345 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.3 ms