Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CLOCKO15516 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms