Protein–RNA interactions for Protein: O15230

LAMA5, Laminin subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 3,695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5O15230 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LAMA5O15230 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms