Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBDO15205 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBDO15205 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBDO15205 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBDO15205 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBDO15205 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBDO15205 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBDO15205 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBDO15205 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBDO15205 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBDO15205 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBDO15205 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBDO15205 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBDO15205 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBDO15205 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBDO15205 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBDO15205 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBDO15205 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBDO15205 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBDO15205 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBDO15205 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBDO15205 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBDO15205 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBDO15205 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBDO15205 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
UBDO15205 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBDO15205 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBDO15205 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBDO15205 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
UBDO15205 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBDO15205 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBDO15205 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBDO15205 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBDO15205 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBDO15205 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBDO15205 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBDO15205 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBDO15205 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBDO15205 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBDO15205 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBDO15205 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBDO15205 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBDO15205 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBDO15205 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBDO15205 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
UBDO15205 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBDO15205 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBDO15205 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBDO15205 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBDO15205 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBDO15205 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBDO15205 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBDO15205 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBDO15205 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBDO15205 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBDO15205 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBDO15205 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBDO15205 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBDO15205 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBDO15205 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBDO15205 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBDO15205 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBDO15205 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBDO15205 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBDO15205 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
UBDO15205 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBDO15205 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
UBDO15205 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
UBDO15205 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBDO15205 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBDO15205 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
UBDO15205 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBDO15205 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBDO15205 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBDO15205 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBDO15205 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBDO15205 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBDO15205 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBDO15205 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBDO15205 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBDO15205 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBDO15205 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBDO15205 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBDO15205 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBDO15205 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBDO15205 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBDO15205 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBDO15205 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBDO15205 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBDO15205 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBDO15205 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBDO15205 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBDO15205 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBDO15205 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBDO15205 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBDO15205 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBDO15205 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBDO15205 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBDO15205 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBDO15205 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms