Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BCKDKO14874 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms