Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVV-1B6SEH8 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms