Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms